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O objetivo é proporcionar ao estudante competências, aptidões e conhecimento aprofundados no âmbito do tema da tese de doutoramento, iniciando o projeto de investigação num domínio científico, ao mesmo tempo que realiza a sua formação curricular em cursos, rotações laboratoriais e seminários. Inclui a preparação de um pequeno relatório sobre o trabalho desenvolvido, com referência a resultados preliminares, caso existam, centrado num plano de tese de investigação translacional na vertente de descoberta de alvos terapêuticos e mecanismos, design de fármacos, desenvolvimento pré-clínico ou segurança dos medicamentos, preenchendo a lacuna da translação entre a descoberta e a utilização de produtos e serviços inovadores de diagnóstico e terapêutica.
O Doutoramento em Farmácia promove a formação científica especializada, a conceção e o desenvolvimento de investigação original e criativa, a análise crítica de ideias novas e complexas, a valorização das capacidades de comunicação individuais com pares e com a sociedade, bem como a promoção do progresso tecnológico, social e cultural na sociedade do conhecimento. O início do trabalho experimental conducente à elaboração da tese de doutoramento propicia, em conjunto com o seminário e com a estruturação final do plano de tese, uma visão completa e global do estado da arte e da vivência experimental necessárias à resolução de uma questão original e relevante. Mais uma vez, o arranjo modular de atividades de formação é consistente com o foco na formação em investigação e na mobilidade.