| 2021 | "Lifetime Achievement Award" | José A. Guimarães Morais | Docente |
| 2021 | Projetos distinguidos no Concurso “CaixaResearch de Investigação em Saúde 2021”
| Ana Rita Vaz, Cecília Rodrigues, Dora Brites e João Gonçalves | Docentes e Investigadora |
| 2021 | Seleção para programa do “Nanotechnology Characterization Laboratory” | Helena Florindo | Docente |
| 2021 | Medalha de Honra | Fátima Falcão | Docente |
| 2021 | Integração na "FEBS Women in Science"
| Graça Soveral | Docente |
| 2021 | Nomeação para a Comissão Executiva da Comissão de Ética para a Investigação Clínica | Hélder Dias Mota Filipe | Docente |
| 2020 | Diretor do Departamento de Regulação e Pré-qualificação da Organização Mundial de Saúde | Rogério Gaspar | Docente |
| 2020 | "Prémio de Melhor Comunicação Oral" | Ana Paula Francisco , Carla Eleutério , Cecília Rodrigues , Eduarda Mendes , Jacinta Pinho, Joana Amaral , Maria Jesus Perry , Maria Manuela Gaspar e Mariana Matias | Docentes, Investigadores, Não Docente e Estudante |
| 2020 | "Prémio APFH 2020 de Melhor Poster" | Andreia Rosatella, António Almeida, Carlos Afonso, Helena Margarida Ribeiro e Joana Marto | Docentes e Investigadores |
| 2020 | Nomeação para o Honorary Editorial Board da Precision Nanomedicine | Rogério Gaspar | Docente |
| 2020 | "Research Grant” da Federação Internacional Farmacêutica | Catarina Bernardo | Estudante |
| 2020 | Reeleição para mais um mandato no Executive Committee da EUFEPS | Rogério Gaspar | Docente |
| 2020 | "CRS Immuno Delivery Young Investigator Award 2020" | Helena Florindo | Docente |
| 2019 | Prémio Gilead-Biotecnologia Farmacêutica | Ana Margarida Pinto Fonseca Amaro Viegas, Ana Marta Silva Reis, Khevin Anjai Jassantilal, Tomás Serra Velez | Estudantes |
| 2019 |
Bolsa do Programa Gilead GÉNESE 2019
| José Miguel Azevedo Pereira | Docente |
| 2019 | Prémio de Imunologia “Professora Manuela Catarino” 2018/2019
| Mariana Brunheta | Estudante |
| 2019 | “Presidência da Associação de Farmacêuticos dos Países de Língua Portuguesa” | Hélder Mota Filipe | Docente |
| 2019 | “Prêmio Octavio Frias de Oliveira 2019”
| Luísa Corvo, Manuela Carvalheiro, Maria Bárbara Martins | Investigadoras |
| 2019 | Presidência do Grupo Farmacêutico da União Europeia | Duarte Santos | Docente |
| 2019 | Medalha de Serviços Distintos – Grau Ouro | Ana Paula Martins | Docente |
| 2019 | Bastonária da Ordem dos Farmacêuticos | Ana Paula Martins | Docente |
| 2019 | Presidência do Colégio de Análises Clínicas e Genética Humana da Ordem dos Farmacêuticos | Rui Pinto | Docente |
| 2018 | Presidência da Sociedade Portuguesa de Bioquímica | Graça Soveral | Docente |
| 2018 | Prémios da Associação Portuguesa de Farmacêuticos Hospitalares | Carolina Chaves, Joana Marto, Mário Santos, Filipa Duarte Ramos , Armando Alcobia, Luís Antunes, M. Rosário Bronze e Helena Margarida Ribeiro . Filipa Cosme Silva, Ana Castro, Arlindo Ferreira, Helena Luna Paus, Vasco Rodrigues, João Paulo Cruz , Aida Duarte, Sandra Simões , António J. Almeida | Docentes e Investigadores |
| 2018 | Prémio de Imunologia “Professora Manuela Catarino” 2017/2018 | Inês Martins | Estudante |
| 2018 | Vice-Presidência do Comité de Medicamentos para Uso Humano | Bruno Sepodes | Docente |
| 2018 | Bolsa de Inovação (BInov | SRSRA) | Joana Marto, Filipa Cosme Silva, António J. Almeida , Aida Duarte, Sandra Simões , Arlindo Ferreira, Ana Castro, Vasco Rodrigues, João Paulo Cruz , , Carolina Chaves, Filipa Duarte Ramos , Rosário Bronze , Mário João Santos, Luís Antunes Armando Alcobia, Manuela Pimenta e Quirina dos Santos Costa | Docentes e Investigadores |
| 2018 | “Iniciativa Ibérica de Investigação e Inovação Biomédica, i4b” | Rui Castro | Docente |
| 2018 | “ImmunoTools special Award” 2018 | Alexandra Brito | Docente |
| 2018 | Menção Honrosa do 10.º Prémio Crioestaminal | Susana Solá | Docente |
| 2018 | Vice-Presidência da EUFEPS | Rogério Gaspar | Docente |
| 2018 | 2.ª edição do Prémio Janssen Inovação | Elsa Anes, David Pires e Nuno Carmo | Docente e Investigadores |
| 2018 | “ESCMID Research Grant” | Maria João Catalão | Docente |
| 2018
| Grã-Cruz da Ordem da Instrução Pública | Maria Odette Santos-Ferreira | Docente |
| 2018 | Melhor Tese de Doutoramento em Química Medicinal | Ricardo Ferreira | Estudante |
| 2018 | “Black Pearl Award” | Bruno Sepodes | Docente |
| 2017 | “Grant for Multiple Scleroris Innovation Award”
| Adelaide Fernandes | Docente |
| 2017 | Prémio de Imunologia “Professora Manuela Catarino” 2016/2017 | Tiago Janela | Estudante |
| 2017 | Bolsas do Programa Gilead GÉNESE – INVESTIGAÇÃO 2016 | Elsa Anes,
Marta Calado,
David Pires,
Nuno Carmo,
Quirina dos Santos Costa,
Dora Brites,
Adelaide Fernandes,
Ana Rita Vaz Botelho | Docentes e Investigadores |
| 2017 | Académico Correspondente Estrangeiro da Real Academia Nacional de Farmácia de Espanha | Rogério Gaspar | Docente |
| 2016 | Prémio Janssen Inovação 2016 | Elsa Anes, David Pires, Nuno Carmo | Docente e Investigadores |
| 2016 | Prémio ”Ibero-americano de Química Orgânica”
| Carlos Afonso | Docente |
| 2016 | Prémio “Revista Dor Bene Farmacêutica” 2016 | Filipa Cosme Silva,
Joana Marto,
Ana Salgado,
Vasco Rodrigues,
Maria Piedade Ferreira,
Paula Machado,
Alexandra Silva,
António J. Almeida
| Docentes e Investigadores |
| 2016 | Vice-Presidência da Sociedade Europeia de Farmácia Clínica | Fernando Fernandez-Llimos Somoza | Docente |
| 2016 | Prémio Sociedade Farmacêutica Lusitana | Mafalda Branco | Estudante |
| 2016 | Prémio de Investigação Científica Professora Doutora Maria Odette Santos-Ferreira 2016 | Filipa Duarte-Ramos | Docente |
| 2016 | Prémio “Best Oral Communication” | Mariana Reis | Estudante |
| 2016 | “Top Communication Award” | Pedro Perdigão | Estudante |
| 2016 | 2.º prémio do Concurso de Investigação em Ciências Morfológicas | Alexandra Brito,
Dora Brites,
Cátia Janota | Docente e Investigadoras |
| 2016 | Menção Honrosa do Prémio APRH | Vanessa Gaffney | Estudante |
| 2016 | Bastonária da Ordem dos Farmacêuticos | Ana Paula Martins | Docente |
| 2016 | Presidência do Colégio de Análises Clínicas e Genética Humana | Rui Pinto | Docente |
| 2016 | Bolsa do Programa Gilead GÉNESE 2016 | José Miguel Azevedo Pereira, Elsa Anes, Marta Calado, David Pires, Nuno Carmo e Quirina Santos Costa | Docentes e Investigadores |
